Музей истории ГУЛАГА – функциональное приспособление в прошлом жилого здания под специфические нужды музея памяти. Создано двусветное экспозиционное пространство, система открытого хранения, развитая структура мест общего пользования — кафе, касса, гардероб, книжный магазин, кинозал, библиотека. Здание венчает мансарда — помещение для временных выставок с открытой террасой, видовой точкой для созерцания сада памяти. Три фасада здания отделаны медью, оксидирование и, как следствие, постепенное потемнение фасадов олицетворяет работу памяти над травмой.

Экспозиция музея расположена на двух уровнях, осмысленных концептуально — первый уровень: «материализация памяти», обеспечивающая контакт с экспонатами, связанными с ГУЛАГом. Второй уровень — «взаимодействие с историей» — состоит из аналоговых интерактивных модулей, в процессе взаимодействия с которыми,  зрителям открывается история ГУЛАГа.

Концепция постоянной экспозиции построена на анализе фондовой коллекции музея и включает в себя несколько типологических элементов. Входной зал экспозиции встречает посетителей постоянной выставкой «ГУЛАГ за каждой дверью». Это место, откуда посетитель «проваливается» на этаж ниже – уровень истории ГУЛАГа, следы которого сейчас можно обнаружить в России практически везде. Посетителя затягивает  лабиринт безвременья – он будто в пищеводе Уробороса – в хронологии развития лагерной системы. Здесь, в пространстве беспамятства, застряли кристаллы «маленьких историй» – витрины персональных  комплексов из коллекции музея. Посетитель слушает эти истории, активируя механизм мультимедийного взаимодействия, и «освобождая» таким образом заключенных из плена забвения.

Отдельные пространства в музее посвящены Большому террору, где пол состоит из стреляных гильз, детям в ГУЛАГе, наказанным народам и проекту видеоинтервью «Мой ГУЛАГ», а также экспедициям музея в места заключения.

Финал экспозиции – храмовое пространство коллективной рефлексии, где беспрерывно читаются имена тех, кто прошёл через ГУЛАГ или остался там навсегда. Отсюда посетитель начинает путь к реальности, впервые на своём пути сталкиваясь с открытым окном на улицу.